郭光业教授认为胃食管反流病临证可以根据不同主证辨证论治。以烧心、吐酸为主者首先从肝论治。报道称大约有一半的患者表现为烧心。如果病情比较轻、没有明显热象，比如舌质不红、脉象不滑不数，而更多的表现为胸胁胀满、嗳气、心情不畅等。则从肝胃不和论治，疏肝理气、和胃降逆。以柴胡疏肝散加减，柴胡6-10g，白芍10-15g，陈皮10g，枳实6-10g，香附10g，川芎6g，炙甘草6g。如果脉象不是很弦实，则枳实易枳壳，这种情况比较多。本方疏肝有余，和胃不足。因此，实际应用时往往加一些和胃之品，比如加半夏10g、茯苓15g，合方中的陈皮、炙甘草为二陈汤，二陈汤是燥湿化痰、理气和胃基础方；再加炒谷芽15g、炒麦芽20g。
如果临床表现以烧心、吐酸为主，则用柴胡疏肝散合左金丸加减：柴胡6-10g，枳壳6-10g，(炒)白芍15g，牡丹皮10g，(焦)栀子10g，香附10g，旋覆花10g，赭石15g，黄连2-6g，吴茱萸1-3g，甘草6g。如果以胃脘灼痛为主一般采用左金丸合化肝煎加减：黄连2-6g，吴茱萸1-3g，栀子10g，丹皮10g，白芍15g，陈皮10g，半夏10g，乌贼骨10g，浙贝母10g，煅瓦楞子30g。左金丸性味较偏，服后常常有胃脘、胸骨后烧热的感觉，所以应用时常常配伍海螵蛸、煅瓦楞子、浙贝母、炒谷芽、炒麦芽等。
如果以“口苦”为主证，同时伴有恶心和/或呕吐，舌红苔黄腻、脉弦滑，或伴有急躁易怒、心烦失眠。则从“胆热犯胃证”论治，清化胆热，降气和胃，以龙胆泻肝汤合温胆汤加减。龙胆草3-6g，柴胡6g，(焦)栀子10g，黄芩10g，当归10g，旋覆花10g，赭石15g，半夏10g，竹茹10g，枳壳10g，陈皮10g，甘草6g，此时枳壳易枳实更对症些。
中医共识中提到温胆汤，在GERD临床单独使用的不多，往往根据辨证情况与它方配伍应用。方中有半夏、陈皮之辛燥，又配伍竹茹、枳实之微凉，但郭教授认为此方总体略微偏凉，其应用指征是痰热郁阻。主证是呕恶食少，胸脘满闷，舌苔厚腻微黄，脉弦滑。其中二陈汤用一般量，竹茹、枳实则视体质强弱用6-10g。如果以痰郁为主不见热象，而以咽喉不适如有痰梗为主要表现，同时伴有嗳气或反流者，则根据“中医共识”的气郁痰阻证论治，开郁化痰，降气和胃，方剂选用旋覆代赭汤合半夏厚朴汤加减：旋覆花10g，赭石15g，半夏10g，厚朴6g，茯苓15g，紫苏叶6g，枳壳6-10g，香附10g，太子参15g，生姜10g，大枣3枚、甘草6g。
“共识”中的中虚气逆证也称为肝郁脾虚证。体质较弱、病情较轻，或者应用西药控制症状后的维持治疗常见这一证型。四逆散、六君子汤都采用一般用量，不宜偏颇，常加海螵蛸、三七、白芨等。还应可根据肝郁与脾虚的偏重加味，比如肝郁明显则加香附、佛手、当归；脾虚明显则加黄芪，虽然黄芪升补，但脾升胃降是相辅相成的，脾的升清功能正常才更有利于胃气和降，甚至有时应用升陷汤（黄芪、党参、白术、当归、柏子仁、升麻、柴胡、桔梗、炒谷芽、枳实。）加味治疗GERD而效。
血瘀形成的病机不同，治疗有异，“中医共识”的瘀血阻络是从肝气郁结逐渐发展而来，气滞血瘀明显，主要表现为胸骨后灼痛或刺痛，舌质紫暗或有瘀斑，脉涩。没有虚像，为单纯的实证，所以应用血府逐瘀汤加减治疗。“中西医共识”的气虚血瘀证是从脾虚气滞而来，虚实夹杂，所以，以四君子汤合丹参饮加减治疗。此时，烧心吐酸往往不是主证。因为到了血瘀形成的阶段，证情一般比较复杂，此时在具体用药上不好统一，多是自己的经验用药，但总的原则应该是活血不碍脾、不伤血的前提下使胃气和降，脾气敦厚，恢复其正常的升降功能。
“中西医共识”提出了寒热错杂证，治以辛开苦降，和胃降气，方药用半夏泻心汤加减。半夏泻心汤的主治证是痞满，临床应用的关键主要是辨明寒与热的多少，从而确定寒药与热药的用量配伍。
另外，在临床上常遇到以下几种证型：
1．饮食停滞：嗳气伴有（不消化的）酸腐臭味，嗳声闷浊或恶心，嗳气不连续发作，胸脘痞闷，不思饮食，大便有（不消化的）酸腐臭味或便秘，舌苔厚腻，脉象滑实。
治法：消食和胃，行气消痞
方药：越鞠保和丸加减：川芎6g，苍术6g，醋香附10g，炒栀子10g，半夏10g，陈皮10g，云苓15g，炙甘草3g，鸡内金10g，焦三仙30g，大黄3g，段瓦楞子30g。
2．脾胃湿热：脘灼热疼痛，嘈杂泛酸，口干口苦，渴不欲饮，口甜粘浊，食甜食则冒酸水，纳呆恶心，身重肢倦，小便色黄，大便不畅，舌苔黄腻，脉象滑数。
治法：清热化湿，和胃消痞
方药：黄连温胆汤：黄连6g，半夏10g，陈皮10g，云苓15g，甘草6g，枳实6g，竹茹6g，吴茱萸2g，厚朴6g，旋覆花10g，紫苏6g，炒栀子6g，大黄炭3g，煅瓦楞子30g，海螵蛸15g。
3．寒湿郁滞：食少纳呆，腹胀便溏，泛恶欲吐，嗳气吞酸，口淡不渴，头身困重，肢体倦怠，舌质淡、舌苔白厚腻或水滑，脉濡缓。
治法：温化寒湿，行气和胃
方药：半夏12g，陈皮10g，云苓15g，炙甘草6g，党参15g，苍术10g，白术10g，吴茱萸3g，焦三仙30g，白豆蔻10g，藿香10g，佩兰6g。
4．脾胃阴虚：症见嘈杂烧心，吞咽哽噎不顺，胸骨后或胃脘部隐痛，口干咽燥，渴不欲饮，五心烦热，乏力，或体瘦，大便干。舌红少津，苔少或无苔，脉细或数。
治法：养阴益胃，和中降逆
方药：启膈散加减：沙参15g，丹参15g，浙贝母10g，茯苓15g，郁金10g，石斛10g，生地15g，牡丹皮6g，川楝子6g，半夏10g，陈皮10g，甘草6g，煅瓦楞子30g，香橼10g。
5．肝肾亏虚 胃气不和：饮食哽噎不顺，咽干不渴，食少腹胀，午后加重，神疲乏力，腰腿酸软，舌质嫩红、无苔或少苔、舌面光亮水滑，脉弦细无力。
治法：滋养肝肾，理气和胃
方药：熟地黄15g，当归10g，白芍10g，干姜6g，炙甘草6g，白术10g，茯苓10g，半夏10g，陈皮10g，海螵蛸15g，炒麦芽15g，炒谷芽15g，砂仁3g，
6．脾胃气虚：反酸，泛吐清水，胃脘冷痛胀满，食欲不振，嗳气，神疲乏力，大便溏薄。舌淡，苔薄白，脉细弱。
治法：补中健脾，和胃降逆
方药：香砂六君子加减：党参10g，白术10g，茯苓10g，炙甘草6g，半夏10g，陈皮10g，木香6g，砂仁3g，煅瓦楞子30g，海螵蛸15g，黄芪10g，大黄炭3g。
7．气血两虚：嘈杂而兼面白唇淡，心悸头晕，失眠多梦，舌质淡，脉细弱。
治法：益气养血，补益心脾
方药：归脾汤加减：党参10g，白术10g，黄芪10g，当归10g，炙甘草6g，茯神15g，远志6g，酸枣仁15g，木香6g，龙眼肉10g，半夏10g，陈皮10g，海螵蛸15g。